摘要

目的运用生物信息学方法分析侧脑室注射促性腺激素抑制激素(GnIH)/RF酰胺相关肽-3(RFRP-3)对卵巢摘除术补充雌激素(OEP)大鼠子宫腔液蛋白的影响,探索GnIH/RFRP-3影响子宫的分子机制。方法本研究通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术结合生物信息学分析侧脑室微量注射GnIH对OEP模型大鼠(n=30)子宫腔液蛋白的影响。比较侧脑室注射GnIH/RFRP-3实验组(n=15,给予2 g/L RFRP-3,16μl/kg)与生理盐水对照组(n=15,给予生理盐水16μl/kg) 6 h后子宫腔液的蛋白质组分,利用Uni Prot数据库筛选差异蛋白并对所得差异蛋白进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路分析。从STRING数据库获得蛋白相互作用数据,利用Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白相互作用网络(PPI)并筛选中心节点蛋白。结果应用LC-MS/MS技术所得质谱数据利用Uni Prot数据库进行搜索鉴定,筛选出差异蛋白419个,其中279个上调,138个下调; GO功能富集分析显示,差异蛋白主要富集于对有机物质的反应,对内源性刺激的反应,对含氧化合物的反应等生物过程; KEGG通路分析显示,差异蛋白在糖酵解、碳代谢、肌动蛋白骨架调节、甲状腺激素合成等代谢途径富集(P<0.05);分析蛋白相互作用网络获得5个中心节点蛋白:白蛋白(Alb)、α-烯醇化酶1(Eno1)、过氧化物酶6(Prdx6)、组织型基质金属蛋白酶抑制剂1(Timp1)、Ras相关C3肉毒素底物1 (Rac1)。结论本实验结果提示,GnIH可能通过下丘脑-垂体生殖轴调节子宫腔液蛋白的分泌,并可能通过上调Alb、Eno1和Prdx6,下调Timp1和Rac1,调节子宫生理及病理过程。

  • 单位
    承德医学院

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