肝癌相关基因表达谱分析及TOP2A表达的临床意义

作者：朱千东; 何其宽; 周青青; 余正平; 钱海鑫^*

来源：肝胆胰外科杂志, 2018, 30(05): 392-398.

• 癌,肝细胞
• 预后
• TCGA数据库
• 生物信息学

目的探讨肝细胞性肝癌(HCC)相关基因的差异表达、富集通路和蛋白互作网络,分析差异表达基因与HCC预后的关系。方法分析TCGA数据库中HCC相关RNAseq数据,筛选差异表达基因,明确基因富集的GO和KEGG通路,构建蛋白互作网络,找到核心蛋白,通过生存分析,明确核心基因与HCC预后的关系。结果通过纳入标准筛选268个差异表达基因,显著富集在GO:mitotic nuclear division(P<0.001),cell division(P<0.001)和negative regulation of growth(P<0.001)及KEGG通路(hsa04110:Cell cycle)(P<0.001),均与细胞分裂与增殖密切相关。通过构建蛋白互作网络,筛选核心基因TOP2A,并在临床样本中得到验证(P<0.001)。生存分析显示,TOP2A的表达量与总体生存时间显著负相关(P=0.002)。结论 TCGA高通量数据分析是筛选肿瘤预后靶点的有效途径,TOP2A的高表达是肝细胞性肝癌预后的不良因素。

• 单位
  苏州大学附属第一医院; 温州医科大学附属第一医院