基于SSR标记的石榴品种遗传多样性分析和指纹图谱构建

作者:冯立娟; 程云; 王传增; 焦其庆; 尹燕雷*
来源:山东农业科学, 2023, 55(12): 26-33.
DOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2023.12.004

摘要

为明确国内主产区不同主栽石榴品种的遗传多样性,构建DNA指纹图谱,本研究以30个石榴品种为试材,利用琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳筛选多态性引物,建立了石榴品种SSR分子标记鉴定体系,然后利用样品信息与指纹代码配置组合的串联代码,构建了不同石榴品种的DNA指纹图谱。结果表明,从36对引物中筛选出扩增产物条带清晰稳定、多态性高的引物10对,共检测出48个等位基因,平均为4.8个,观察杂合度和期望杂合度平均分别为0.50和0.60,Shannon’s指数和Nei’s多样性指数平均分别为1.11和0.59,多态信息含量在0.33~0.72之间,平均为0.53。聚类分析发现,30个品种被分为3组,A组包括16个品种,B组包括8个品种,C组包括6个品种。基于样品、引物和等位基因信息,构建了30个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码。本研究结果可为石榴种质资源分子鉴定及开发利用提供理论依据。

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