甜樱桃GH3基因家族全基因组鉴定与表达分析

作者：侯黔东; 沈天娇; 余欢欢; 仇志浪; 文壮; 张惠敏; 吴亚维; 文晓鹏^*

来源：园艺学报, 2021, 48(12): 2360-2374.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0911

• 甜樱桃
• IAA酰胺合成酶
• 基因家族
• 生长素响应
• 表达分析

以甜樱桃(Prunus avium L.)为材料,对IAA酰胺合成酶(Gretchen Hagen 3,GH3)基因家族全基因组进行鉴定及生物信息分析;同时,分析其在不同组织中的表达及对外源GA3、ABA、MeJA、IAA的响应。结果表明,甜樱桃基因组中共存在8个GH3基因,根据在染色体的位置依次命名为Pav GH3.1～PavGH3.8,编码区长度为1 683～1 851 bp,预测大多数基因定位在叶绿体中;PavGH3外显子数3或4,且有较多保守基序;除5号和7号染色体外,其他染色体均有分布;启动子存在ABA、MeJA等6种激素响应元件;PavGH3在进化上分为2组,且PavGH3.5和PavGH3.6与拟南芥GH3一些成员存在共线性。表达分析显示,PavGH3.2、PavGH3.6和PavGH3.7为3个主要表达基因。PavGH3.4和PavGH3.5在第2次生理落果中较第1次上调表达,与正常果实相比,第1次生理落果中PavGH3.5和PavGH3.7下调表达,PavGH3.4和PavGH3.6上调表达。PavGH3.2、PavGH3.3、PavGH3.6和PavGH3.7为主要响应激素的基因。推测PavGH3基因家族广泛参与甜樱桃的生长发育,且可能与落果关系密切。

• 单位
  生命科学学院; 贵州省农业科学院; 贵州大学