毛果杨1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸合酶(HDS)基因的生物信息学分析(英文)

作者：刘立辉; 李成浩; 杨静莉; 夏德安

来源：Agricultural Science & Technology, 2012, (01): 24-28.

DOI：10.16175/j.cnki.1009-4229.2012.01.046

• HDS
• 毛果杨
• 生物信息学
• 萜类 HDS
• Populus Trichocarpa
• Bioinformatics information
• Hemiterpene

[目的]研究HDS基因间的同源性及其进化关系。[方法]以毛果杨的HDS基因为研究对象,利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析。并与其他10个物种的HDS基因序列进行多重比对与进化分析。[结果]毛果杨HDS基因的单链mRNA序列长1956bp,编码由656个氨基酸组成的蛋白质,该蛋白质相对分子质量为72937.03,其中含量最高的是Leu,为10.50%;整个多肽中疏水性氨基酸只占39.63%,有10个亲水区和6个疏水区;与其他10个物种同源性多重比对发现同源性最高达99%。[结论]毛果杨HDS基因处于稳定状态,编码的蛋白为亲水性...

• 单位
  林木遗传育种国家重点实验室; 东北林业大学