盐肤木非胚性愈伤组织与胚性愈伤组织的比较转录组分析

作者：国少旭; 徐子莲; 田亚丽; 龚清; 刘文

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 盐肤木
• 转录组测序
• 体细胞胚胎发生
• 非胚性愈伤组织
• 胚性愈伤组织

基于体细胞胚胎发生途径的植物再生体系具有数量多、速度快、再生率高等特点，是木本植物重要的快繁技术之一。本研究针对盐肤木(Rhus chinensis Mill.)体细胞胚胎发生途径中两种典型的愈伤组织(非胚性愈伤组织与胚性愈伤组织)开展比较转录组分析，以解析体细胞胚胎发生的分子机制。共组装得到37231个Unigene，并确定了8 458个差异表达基因，其中4 493个表达上调，3 965个表达下调；对差异表达基因进行GO (Gene ontology)功能富集分析，发现差异基因显著富集在激酶活性、细胞蛋白修饰过程、氧化还原酶活性等；对差异表达基因进行KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析发现，差异基因显著富集在苯丙烷类生物合成、植物激素信号转导、苯丙氨酸代谢等途径。考虑到盐肤木富含水解单宁等植物多酚类还原性物质，差异表达基因在氧化还原酶活性以及苯丙烷类生物合成等通路的富集暗示这些途径可能参与盐肤木胚性愈伤组织的诱导。此外，筛选了7个参与水解单宁合成的关键基因，利用qRT-PCR进行表达量分析发现其在胚性愈伤组织中表达升高，且与转录组数据一致，进一步说明水解单宁合成可能与盐肤木胚性愈伤组织的诱导有关。