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摘要
目的：基于计算机辅助药物设计技术中的随机森林模型，筛选出具有潜在成药性和有人类免疫缺陷病毒1亚型(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)整合酶抑制活性的化合物，为HIV-1整合酶抑制剂的开发提供参考。方法：使用关键词从ChEMBL、BindingDB数据库检索出与HIV-1整合酶相关的小分子的数据资料，借助MOE软件、Knime软件等工具构建筛选HIV-1整合酶抑制剂的随机森林模型，并对从ChemDiv数据库中筛选出的小分子进行相似度验证，最后使用ADMET lab工具进行成药性分析。结果：从ChEMBL和Binding DB数据库中收集到5 459个具有IC50值的小分子，通过随机森林模型和相似性搜索筛选出1 267个小分子，将其与作为配体的多替拉韦进行分子对接，得到24个最有小分子，再以ADMET lab软件对其进行成药性分析，最终得到5个成药性较好的小分子，其中最优的2个分子各项吸收指标均较佳，且清除率高、毒性较低。结论：通过随机森林模型的筛选和后续软件工具的虚拟验证，共得到5个具有较好成药性的HIV-1整合酶抑制剂。
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