基于加权基因共表达网络分析法筛选多囊卵巢综合征Hub基因

作者：陈莉; 邹铸; 徐靖原; 沈梦溪; 李俊^*; 姚新生^*

来源：遵义医科大学学报, 2022, 45(04): 491-497.

DOI：10.14169/j.cnki.zunyixuebao.2022.0075

• 多囊卵巢综合征
• Hub基因
• 加权基因共表达网络分析
• 免疫信号通路

目的 多囊卵巢综合征(PCOS)常伴有肥胖表现，探索调控PCOS患者肥胖的关键基因，有益于肥胖型PCOS的诊断与防治。方法 从GEO数据库中下载肥胖型PCOS患者和肥胖非PCOS患者转录组数据，运用加权基因共表达网络分析法(WGCNA)筛选出与PCOS发生发展相关的关键模块，用GO及KEGG对模块功能进行富集分析，进一步挖掘出与PCOS发生发展相关联的中枢基因(Hub gene)。结果 WGCNA一共定义了13个基因共表达模块，从其中4个模块中筛选出与肥胖PCOS相关的189个差异表达基因，这些基因主要被富集到免疫相关的TNF-α和IL-17信号通路，从中最终筛选出PTGS2、IL6、CXCL8、CXCL2、IL1B、S100A9、S100A8、CCL2、ICAM1、LIF、TNFRSF1B和IRF1 12个Hub基因。结论 本研究筛选出与肥胖PCOS相关的关键基因，并进一步聚类到免疫相关信号通路，提示肥胖型PCOS与免疫应答存在相关性。

• 单位
  遵义医科大学