胰腺癌生存相关lncRNA的筛选和验证

作者：赵雪; 马军; 马佳康; 李雨濛; 任凯凯; 张中冕; 刘宗文; 胡晓冬; 吕梦; 王健^*

来源：胃肠病学和肝病学杂志, 2019, 28(05): 559-562.

• 胰腺导管腺癌
• lncRNA
• 生物标志物

目的通过生物信息学分析筛选出与胰腺导管腺癌(pancreatic ductal adenocarcinoma,PDAC)患者生存相关的长链非编码RNA(lncRNA),并预测其靶基因及相关信号通路。方法通过肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载PDAC及癌旁组织的表达谱数据及相应的临床资料,并对这些数据进行生存分析,然后通过共表达分析及基因富集分析找到与差异lncRNA表达相关的mRNA和信号通路。最后通过细胞实验验证AC015660.1、CASC8在PDAC细胞中的表达。结果通过TCGA筛选出4个在PDAC中差异表达的lncRNA,其中AC015660.1和CASC8表达上调,对其进行共表达分析,分别预测出2个靶基因mRNA;对进行单基因GSEA分析,预测出8条CASC8可能的作用通路。细胞实验显示,AC015660.1和CASC8均在PDAC细胞中高表达。结论通过生物信息学分析筛选出与PDAC生存相关的lncRNA,为胰腺癌的预后评估提供了潜在靶点。

• 单位
  消化疾病研究所; 郑州大学; 郑州大学第二附属医院