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摘要
为获得辽东丁香（Syringa villosa subsp. wolfii）叶绿体全基因组的基本特征，采用高通量测序技术分析了其叶绿体基因组序列信息，并讨论其系统演化位置。结果表明：（1）辽东丁香叶绿体基因组全长156 517 bp，具有典型的四分体结构；具有131个功能基因，包括36个tRNA基因、8个rRNA基因和87个蛋白质编码基因。（2）该叶绿体基因组蛋白编码区的总密码子偏好性（RSCU）分析显示，RSCU值>1的密码子有31个，其中以A/U碱基结尾的有21个；RSCU值<1的密码子有34个，其中以G/C碱基结尾的密码子有22个。（3）在辽东丁香的叶绿体基因组中，检测出334个散在重复序列，包括170个正向重复序列和164个回文重复序列；检测到227个SSR位点，其中226个位点成功设计出PCR引物。（4）最大似然法构建系统进化树分析显示，辽东丁香与云南丁香（S. yunnanensis）亲缘关系最近。本研究通过对辽东丁香叶绿体基因组重复序列、IR边界、系统发育等进行分析，为辽东丁香后续的分子标记开发、系统发育分析、物种资源鉴定评价、DNA条形码开发等提供参考。
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单位生命科学学院; 辽宁大学
