南荻CCoAOMT基因的克隆与生物信息学分析

作者：洪艳云; 黄志刚; 易图永

来源：中南林业科技大学学报, 2011, 31(10): 94-99.

DOI：10.3969/j.issn.1673-923X.2011.10.016

• 南荻
• 咖啡酰CoA-O-甲基转移酶
• 生物信息学分析
• 木质素

南荻是一种高木质纤维素含量的禾本科多年生草本植物,但其中的高木质素含量严重制约了它作为能源植物的开发利用.采用
RT-PCR及RACE方法从南荻中分离到G木质素单体形成的关键酶CCoAOMT家族的一个基因,将该基因序列递交到GenBank,登录号为JF965572.该基因全长工1206 bp,含有一个786 bp的阅读框,编码一个261aa的蛋白,分子量约为29 kD.通过NCBI在线比对发现该基因的预测蛋白与同为禾本科玉米的CCoAOMT酶蛋白有很高的同源性,最高达到94.0％；氨基酸序列多重比较的结果表明,该基因编码肽链含有CCoAOMT类基因全部的保守序列元件；系统进化树分析表明,该基因与玉米的CCoAOMT亲缘关系最近.

• 单位
  湖南农业大学