遗传性耳聋基因芯片检测方法的建立

作者:李维; 王以婷; 刘丽益; 张静
来源:中国优生与遗传杂志, 2016, 24(11): 20-23.
DOI:10.13404/j.cnki.cjbhh.2016.11.008

摘要

目的以膜芯片技术为平台,建立一种遗传性耳聋基因芯片检测方法(PCR-反向点杂交法)。方法根据近期在我国国内开展的大规模耳聋分子流行病学调查结果及Gene Bank上报道的基因信息,设计并合成20条探针及5对引物检测与遗传性耳聋相关的四个热点基因(GJB2、GJB3、SLC26A4和12S r RNA)中的10个突变位点,10条探针点至尼龙膜上制成反向杂交膜芯片,应用五重PCR技术一管完成所有位点的扩增,建立了一种一次实验就可以检测非综合征遗传性耳聋四个热点基因上10个位点突变的方法。结果遗传性耳聋基因芯片检测方法对10种基因型检测的灵敏度为10ng/μL;除肝素抗凝剂外,EDTA和枸橼酸钠抗凝剂都不是本检测方法的干扰物质,溶血、脂血和黄疸样本都不影响本方法的检测结果;应用这种方法检测临床样本,检测结果与测序结果比较,阳性符合率为100%,阴性符合率为100%,总符合率为100%,经χ2检验分析,遗传性耳聋基因检测方法与测序法没有明显差别;重复性测试结果显示在不同的实验条件下检测结果完全一致,该方法能稳定重复检出。结论成功的建立了一种灵敏度高、特异性好、检测结果稳定、可靠、通量较高的遗传性耳聋基因芯片检测方法。

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