基于免疫基因女性生殖系统原发性恶性淋巴瘤分型和免疫治疗敏感性分析

作者：彭帅羚

来源：中国妇幼保健, 2021, 36(13): 2945-2948.

DOI：10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2021.13.006

• 女性生殖系统
• 原发性恶性淋巴瘤
• 免疫基因
• 分型

目的探索基于女性生殖系统原发性恶性淋巴瘤相关免疫基因的共识聚类分型和分型群组之间免疫治疗的敏感性。方法从人类基因图谱（TCGA）数据库和基因表达综合（GEO）数据库（GSE138734,GSE168422）下载恶性淋巴瘤数据全转录组测序数据RNA-seq,提取其中原发部位为女性生殖系统的数据集合,进行批次矫正和对数值转换。从IMMPORT数据库提取免疫基因相关信息。使用R软件和edge R包进行差异基因分析。以差异倍数（FC）大于4,即|log2FC|>2,P 1）; 4个基因表达量越高预后越好（HR1）;多因素COX分析表明,年龄和聚类分型群组是女性生殖系统恶性淋巴瘤患者预后相关的独立危险因素（P1）。免疫治疗靶点敏感性分析表明PD-L1在群组1中的表达量（11.31±5.14）显著高于其在群组2中的表达量（3.76±1.41）,差异有统计学意义（t=19.487,P<0.05）,群组1接受PD-L1靶点的免疫治疗较群组2敏感。结论基于差异表达的免疫基因的共识聚类分型具有良好的区分度,可以表明样本特征。群组1接受PD-L1靶点的免疫治疗较群组2敏感。

• 单位
  中国科学院大学; 浙江省肿瘤医院