ALCAM基因敲除对苯并[a]芘恶性转化细胞THBEc1转录组的影响

作者：李璐迪; 陈洁; 周川; 马雪; 付娟玲; 姚碧云; 赵鹏^*

来源：毒理学杂志, 2021, 35(01): 5-9.

DOI：10.16421/j.cnki.1002-3127.2021.01.002

• 苯并[a]芘
• ALCAM
• 转录组
• THBEc1细胞

目的检测活化白细胞黏附分子(ALCAM)基因敲除后苯并[a]芘(BaP)恶性转化细胞THBEc1转录组的改变,探究ALCAM在BaP致癌中的作用,为进一步阐明BaP致癌机制提供线索。方法选择两株ALCAM基因纯合敲除THBEc1细胞THBEc1-ΔALCAM-c5和THBEc1-ΔALCAM-c7及一株敲除对照细胞THBEc1-ctrl作为模型,利用转录组测序技术筛选细胞间差异表达基因,使用DAVID数据库对差异表达基因进行GO分析和KEGG通路富集分析。利用克隆形成实验检测ALCAM敲除对THBEc1细胞增殖的影响。结果转录组测序共发现336个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞和THBEc1-ctrl细胞中表达差异在2倍以上(FDR<0.05),其中62个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞中的表达低于THBEc1-ctrl细胞,274个基因在两株ALCAM敲除THBEc1细胞中的表达高于THBEc1-ctrl细胞。差异表达基因涉及多种生物学功能,主要包括细胞增殖、迁移、黏附、信号转导、凋亡、血管生成、炎症反应和免疫应答等。克隆形成实验证实ALCAM敲除可降低THBEc1细胞增殖能力。结论敲除ALCAM后BaP恶性转化细胞THBEc1转录组明显改变,增殖能力明显降低。ALCAM可能在BaP致癌中发挥重要作用,并可能作为BaP致癌的潜在生物标志物。

• 单位
  公共卫生学院; 北京大学