鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异对血清IgG含量的影响

作者：周伟; 刘冉冉; 郑麦青; 文杰; 赵桂苹; 陈国宏; 常国斌; 张磊; 孙艳发; 李鹏; 孙艳

来源：畜牧兽医学报, 2013, (09): 1355-1362.

• 鸡
• 16号染色体
• CNV
• 单倍型和双倍型
• 血清IgG chicken
• GGA16
• haplotypes and diplotypes
• IgG

旨在探讨鸡16号染色体SNP单倍型和拷贝数变异(Copy number variation,CNV)对血清IgG含量的影响。采用鸡60KSNP芯片对995只北京油鸡进行分型,同时测定80日龄IgG含量。分别采用PennCNV、Haploview 4.1和PHASE 2.0软件对拷贝数变异、连锁不平衡、单倍型分析及与IgG的关联分析。结果发现,该区域存在2个单倍型块和2个拷贝数变异区。Block1(59 984~73 717bp)单倍型分析发现3种单倍型和6种双倍型,其中双倍型H1H2血清中IgG含量是H3H3的1.45倍(P<0.05);Block2(102 256~138 076bp)内发现...

• 单位
  动物营养学国家重点实验室; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 扬州大学