叶绿体是植物进行光合作用的主要场所，是植物细胞特有的细胞器.叶绿体具有相对独立的遗传物质，是半自主性细胞器.本文从叶绿体起源，叶绿体DNA的遗传方式，叶绿体基因组的基本结构以及叶绿体基因组的进化四个方面综述了叶绿体基因组的研究进展.另外，综述了叶绿体基因组在系统发育基因组学、居群遗传学、谱系地理学和叶绿体基因工程中的应用进展.
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