登革病毒1型Ⅰ～Ⅴ基因亚型的基因组差异分析

作者：文送娇; 陈曦; 洪珊; 席珏敏; 王晓丹; 陈俊英; 潘玥; 叶超; 管娇琼; 林垚; 孙强明

来源：中国生物制品学杂志, 2019, (02): 152-156.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.002463

• 登革病毒1型
• 基因亚型
• 基因组
• 结构蛋白
• 二级结构 Dengue virus type 1(DENV-1)
• Genotype
• Genome
• Structural protein
• Secondary structure

目的分析登革病毒1型(Dengue virus type 1,DENV-1)Ⅰ～Ⅴ基因亚型基因组全长核苷酸及氨基酸序列差异。方法通过GenBank搜索DENV-1 5个不同基因亚型的全长基因组序列,获得其相应的氨基酸序列。采用BIOEDIT软件,统计基因亚型间核苷酸突变和氨基酸替代位点,分析其相似度,通过RNA二级结构在线预测网站预测DENV-1不同亚型间3′UTR的二级结构差异,蛋白结构在线预测网站预测主要流行于中国的Ⅰ及ⅤDENV-1基因亚型结构蛋白的二级结构,对其氨基酸组成及编码序列中可能存在的蛋白结合区域等进行差异分析。结果DENV-1 5个基因亚型核苷酸相似性为91. 40%～94....

• 单位
  中国医学科学院医学生物学研究所