基于二代测序的定制化基因panel检测骨髓增殖性肿瘤突变谱

作者：黄秀; 邓萱; 许笑; 张心菊; 张悦晟; 马玮哲; 胡婷婷; 唐古生; 关明^*

来源：中华检验医学杂志, 2019, 42(06): 427-434.

• 骨髓增殖性疾病
• 突变
• 高通量核苷酸序列分析

目的利用由50个靶基因所组成的测序panel, 分析骨髓增殖性肿瘤(MPN)三种主要亚型原发性血小板增多症(ET), 真性红细胞增多症(PV), 以及原发性骨髓纤维化(PMF)的突变谱, 以便为该病的诊断和预后提供有价值的信息。方法回顾性研究方式, 收集2010年至2017年间来自华山医院以及长海医院血液科的MPN患者标本共53例。所有患者的诊断均符合2016年WHO的诊断标准, 包括ET31例(男11例, 女20例, 中位数年龄55岁), PV17例(男12例, 女5例, 中位数年龄65岁), PMF5例(男4例, 女1例, 中位数年龄67岁), 并进行其骨髓或者血液标本DNA的二代测序。根据COSMIC, dbSNP, Clinvar等公共数据库对测序结果进行分析, 绘制MPN人群的突变谱, 并结合患者的临床随访资料进行解读。结果除去典型的JAK2、CALR、MPL突变, 还检测出了另外11种基因的致病性突变, 以及4种与赋予个体MPN疾病易感性相关的寡核苷酸多态性(SNP)位点(rs4858647, rs9376092, rs58270997, rs621940)。平均每个患者的突变基因数目为2.3个。全部患者(53例)中, 基因突变频率由高到低依次为TET2(40%), EZH2(26%), ASXL1(11%), MIR662(6%), SF3B1(6%), BARD1(6%), DNMT3A(4%), KIT(2%), RUNX1(2%), TP53(2%), NRAS(2%)。结论利用靶向基因二代测序技术, 能实现一次性对多例典型的BCR-ABL阴性的MPN患者进行多基因外显子测序, 检测周期可缩短至两天, 可以发现除了JAK2、CALR、MPL突变之外其他的致病性突变, 在临床有较好的应用前景。

• 单位
  复旦大学附属华山医院; 长海医院