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摘要
目的探讨O26∶H11及NM血清型大肠埃希菌中成簇规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的分子分布特征及其与stx噬菌体的关系。方法 135株O26∶H11及NM血清型大肠埃希菌从NCBI数据库获取, 利用CRT软件及CRISPR Finder提取CRISPR信息, 并用Excel软件对间隔序列进行编号及分析CRISPR亚型, 并分析CRISPR与stx噬菌体之间的关系。结果 135株O26∶H11及NM血清型大肠埃希菌中均存在CRISPR结构, CRISPR1包括19个亚型, CRISPR 2.1包括22个亚型, CRISPR2.2包括1个亚型, CRISPR3-4包括1个亚型。stx噬菌体在CRISPR群组C中出现, stx+菌株比stx-菌株拥有更多的间隔序列。结论 CRISPR位点在O26∶H11或NM血清型大肠埃希菌中广泛存在, 且存在着不同的亚型, stx噬菌体与CRISPR的分子分布特征有关, 可能作为鉴定高毒菌株的分子靶标。
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