玉米吐丝期叶绿素指数全基因组关联分析

作者：田小康; 渠建洲; 劳永辉; 李婷; 薛吉全; 徐淑兔^*; 张兴华^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(23): 7613-7624.

DOI：10.13271/j.mpb.018.007613

• 玉米(Zea mays L.)
• 叶绿素指数
• 全基因组关联分析
• SNP标记

叶绿素是植物形成产量的重要因子。为了探究吐丝期叶绿素的遗传机理和代谢机制,本研究以榆林、杨凌两地126份玉米自交系为材料,采用全基因组关联分析的方法将简化基因组测序填充过滤筛选后得到31 561个SNP (Single nucleotide polymorphism)标记,结合叶绿素指数SPAD (Soil and plant analyzer develotrnent)值以及BLUP (Best linear unbiased prediction)值进行分析,共检测到37个显著性关联SNP标记;在LD (Linkage disequilibrium)衰退有效距离上下150 kb内检测到201个候选基因,进一步进行GO富集注释和分析,将叶绿素相关候选基因主要锚定在过氧化氢代谢过程、受体活性、活性氧代谢过程和氮化合物代谢过程的负调控等18个代谢途径上。本研究进一步探究了叶绿素相关代谢遗传机理,对高光效育种和提高作物产量有重要意义。

• 单位
  西北农林科技大学