大花序桉SSR位点多样性和群体结构分析

作者：王莉; 李昌荣; 李发根; 周长品; 翁启杰; 李梅; 吕佳斌; 陈健波; 陈剑成; 项东云^*; 甘四明^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(13): 4470-4478.

DOI：10.13271/j.mpb.017.004470

• 大花序桉
• SSR
• 遗传多样性
• 群体结构

为了获得大花序桉群体变异的可靠信息,本研究基于桉树29个基因组简单序列重复(SSR)标记,筛选了既不偏离哈温平衡、又非群体间分化系数(Fst)离群值的中性SSR用于大花序桉14个群体的遗传多样性和群体结构分析。基于11个中性SSR位点,群体的每位点等位片段数(Na)和特有等位片段数(Npa)平均分别为6.88和4.5,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)平均分别为0.749和0.780,证明群体多样性较高;固定化指数(F)平均为0.040,表明群体内近交水平极低。位点平均Fst为0.120,分子方差分析(AMOVA)中群体间变异只占总方差分量的3.1%,表明群体为中等到低的分化水平。主坐标分析、聚类分析和群体结构分析都将昆士兰州北部与中部群体(各7个)分为不同的亚群体。这为大花序桉种质资源保存和育种策略制定提供了理论的参考依据。

• 单位
  中国林业科学研究院; 中国林业科学研究院热带林业研究所; 广西壮族自治区林业科学研究院; 玉林市林业科学研究所; 林木遗传育种国家重点实验室