女性非吸烟肺癌相关lncRNAs的生物信息学筛选及判断预后价值

作者：李伟; 石柯

来源：临床检验杂志, 2016, 34(10): 791-794.

DOI：10.13602/j.cnki.jcls.2016.10.23

• 长链非编码RNA
• 非吸烟女性肺癌患者
• 基因芯片
• 生物信息学

目的筛选女性非吸烟肺癌患者中的差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库获得女性非吸烟肺癌患者的基因表达芯片GSE19804,利用GEO2R软件分析差异表达基因,利用DAVID数据库对差异基因进行重注释,获取差异表达的lncRNAs,利用Gene-E软件进一步分析和验证lncRNAs的表达情况。结果筛选出与女性非吸烟肺癌相关的差异表达lncRNAs 27个,与正常肺组织相比,11个表达上调,16个表达下调,差异具有统计学意义,其中高表达LINC00467的肺癌患者拥有较好的总生存期[HR(95%CI)=0.75(0.640.88),P<0.01],低表达TINCR的肺癌患者拥有较差的总生存期[HR(95%CI)=1.31(1.111.55),P<0.01]。结论利用生物信息学对已有芯片进行再分析可以快速筛选女性非吸烟肺癌患者相关lncRNAs。

• 单位
  中南大学湘雅医院