人骨髓间充质干细胞成骨分化早期相关的长链非编码RNA的初步研究

作者：胡伟涛; 赵建江; 孙翔; 贾搏; 韩久松; 邱小玲; 褚洪星; 郑相淮

来源：中山大学学报(医学科学版), 2016, 37(03): 384-389.

DOI：10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2016.0066

• 人骨髓间充质干细胞
• 成骨分化早期
• 长链非编码RNA
• 生物信息学分析

【目的】筛选与人骨髓间充质干细胞(h MSC)成骨分化早期相关的长链非编码RNA(lnc RNA),分析其对于h MSC成骨分化早期的影响。【方法】将成骨诱导分化7 d前后的h MSC作为研究对象,利用Agilent lnc RNA芯片技术筛选出成骨诱导分化前后表达量具有2倍差异的lnc RNA,选取其中1条表达量差异较大的lnc RNA利用UCSC Genome Browser分析此lnc RNA邻近蛋白编码基因。【结果】h MSC经过成骨分化诱导7 d后具有明显成骨细胞特征;Agilent lnc RNA芯片技术筛选结果表明,h MSC成骨分化诱导7 d后表达上调的lnc RNA有923条,表达下调的有993条;选择表达上调中表达量差异较大的1条lnc RNA ENST00000585537.1,UCSC Genome Browser生物信息学分析显示其与MAPK蛋白相关。【结论】h MSC成骨分化诱导7 d后lnc RNA表达发生改变,部分表达差异较大的lnc RNA可能通过与相关蛋白编码基因联系影响h MSC的早期成骨分化功能。

• 单位
  广东省口腔医院; 南方医科大学