青藏高原特有植物甘青蒿的全长转录组分析

作者：余静雅; 夏铭泽; 张发起

来源：中国野生植物资源, 2023, 42(12): 17-24.

DOI：10.3969/j.issn.1006-9690.2023.12.003

• 甘青蒿
• 全长转录组
• 三代牛津纳米孔测序
• 功能注释
• 萜类化合物

为深入挖掘甘青蒿功能基因和补充蒿属植物基因资源，采用基于三代牛津纳米孔测序技术（ONT）对甘青蒿叶片进行全长转录组测序，利用生物信息学手段对其进行分析。结果得到了15.66 Gb数据，18 634条非冗余全长转录本，并鉴定出4 358条新转录本。通过与数据库比对，2 184条新转录本及29 154个转录因子得到注释。分析萜类化合物生物合成途径，发现9个候选基因，其中hdr、MCS和CTI12＿AA199400基因可能是甘青蒿萜类化合物生物合成的关键基因；ctcad3、CTI12＿AA295060基因和部分转录因子可能参与甘青蒿的非生物胁迫抗性。本研究可为甘青蒿功能基因挖掘和生物资源利用提供数据基础。

• 单位
  生命科学学院; 中国科学院西北高原生物研究所; 中国科学院大学