海滨木槿EST-SSR分子标记开发及群体遗传多样性评价

作者：王宣; 陈秋夏; 刘宇; 杨升; 魏馨; 周芬芬; 池方河; 刘星^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 海滨木槿
• EST-SSR
• 遗传多样性

基于海滨木槿全长转录组测序数据，本研究旨在发掘一套多态性好、稳定性高的EST-SSR分子标记，用于评估海滨木槿群体遗传多样性水平以及群体间遗传变异与分化格局。采用MISA软件对拼接到的Unigenes进行SSR位点检索，并利用Primer Premier 5.0软件随机对300个位点进行引物设计，通过琼脂糖凝胶电泳对SSR位点进行初筛与复筛，最后采用荧光标记毛细管电泳进行SSR位点多态性与海滨木槿群体遗传多样性分析。通过筛选试验，从300对多态性引物中发掘了并验证了19个具有良好多态性的EST-SSR标记，多态性信息含量(polymorphism information content， PIC)介于0.332～0.647，均值为0.407，所有位点均具有中高度多态性，可用于海滨木槿遗传分析。采用上述标记对海滨木槿3个群体进行遗传多样性分析，其等位基因数、有效等位基因数、Shannon’s指数、观测杂合度和期望杂合度均值分别为2.333、2.045、0.739、0.571和0.496，表明海滨木槿群体具有中等遗传多样性水平。AMOVA分析显示：遗传变异主要来源于种群内。本研究为开展海滨木槿的遗传多样性分析、种质资源评价以及遗传图谱构建提供科学依据。

• 单位
  浙江农林大学; 浙江省亚热带作物研究所