22种樟科植物DNA条形码分子鉴定

作者：许丹芸; 张辉菊; 李可心; 杨全; 高弘扬

来源：中国实验方剂学杂志, 2021, 27(16): 159-166.

DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20211019

• 樟科
• DNA条形码
• 鉴别
• matK
• rbcL
• rpoB

目的:筛选适合樟科植物的DNA条形码,对采集的22种樟科植物进行鉴定分类。方法:以22种樟科植物为实验材料,提取其DNA,使用不同的DNA条形码引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,电泳检测后进行双向测序。采用Codon Code Aligner软件对测序峰图和序列进行校对、拼接并去除正反向引物序列。将序列导入DNAMAN,进行多序列对比,查看并分析碱基变异位点。用MEGA计算不同种植物的遗传距离(K2P),根据遗传距离分析变异程度,基于邻接法构建系统进化树。结果:采用3对DNA条形码通用引物对22种樟科植物的DNA进行扩增测序后通过比较基因序列的特异碱基位点成功鉴别出其中20种植物。结论:matK序列能鉴定4个木姜子属植物;rbcL除粗脉桂外,对实验材料中楠属的3个物种都能进行区分;matK+rbcL+rpoB序列结合可鉴别20种樟科植物。其中matK序列对樟科植物鉴定效果最好,结果也表明将DNA条形码对植物进行组合鉴定,效果更佳。从分子角度研究樟科植物之间的亲缘关系,同时也为药用植物资源调查、栽培种植、开发保护利用提供依据。

• 单位
  广东药科大学