运用SNP-CAPS分子标记定位香菇重要功能基因的研究

作者：黄杰; 谭琦; 鲍大鹏

来源：上海农业学报, 2015, 31(02): 13-17.

DOI：10.15955/j.issn1000-3924.2015.02.03

• 香菇
• 功能基因
• 非同义SNP
• SNP-CAPS标记

根据香菇单核菌丝体135A和135B的全基因组测序,通过生物信息学方法分析筛选出香菇功能基因CAP、GLA1、TLG1结构域中的非同义SNP位点,开发出3对SNP-CAPS分子标记。结果表明:这3对功能基因SNP-CAPS分子标记可将23个香菇单核体供试菌株分成135A型(分别为16株、20株、2株)和135B型(分别为7株、3株、21株),这些标记表现出的多态性为进一步研究香菇菌株的来源和功能基因的定位提供参考价值;并建立起可以简单、快速、准确地调查重要功能基因的SNP位点变异情况的方法。

• 单位
  农业部; 上海市农业科学院食用菌研究所; 上海海洋大学