川赤芍实时荧光定量PCR内参基因的筛选与验证

作者：罗梦婷; 曲别军长; 俸明康; 曲别阿香; 何斌; 海来约布; 李文兵; 杨正明; 李莹; 阎新佳; 刘圆^*; 张绍山^*

来源：中国中药杂志, 2023, 48(21): 5759-5766.

DOI：10.19540/j.cnki.cjcmm.20230726.101

• 川赤芍
• 实时荧光定量PCR
• 内参基因
• Actin
• GAPDH

川赤芍与芍药共同作为《中国药典》著名药材赤芍的基原植物，具有重要的药用价值，且在花卉市场的潜力巨大。筛选稳定可靠的内参基因是开展川赤芍分子研究的必要前提。该研究从川赤芍的转录组数据中选取Actin和GAPDH 2个内参基因作为候选基因，利用实时荧光定量技术(qRT-PCR)检测2个候选基因在川赤芍的不同组织(韧皮部、木质部、茎、叶、叶柄、子房)和不同生长时期(萌动期、开花期、休眠期)的表达水平，然后利用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCT和RefFinder综合分析2个内参基因表达的稳定性，结果表明Actin和GAPDH在川赤芍不同组织和不同生长时期中的表达模式均稳定。该研究进一步检测川赤芍转录组数据中8个基因(Pv-TPS01、Pv-TPS02、Pv-CYP01、Pv-CYP02、Pv-CYP03、Pv-BAHD01、Pv-UGT01、Pv-UGT02)在不同组织中的表达水平，结果表明，以Actin和GAPDH分别作为内参基因，8个基因在川赤芍不同组织部位的表达趋势均一致，验证了Actin和GAPDH作为川赤芍内参基因的可靠性。综上，该研究发现Actin和GAPDH可作为川赤芍不同组织和不同生长时期中基因表达水平研究的内参基因。

• 单位
  西南民族大学