山西糜黍遗传差异评估及分子身份证构建

作者：冯智尊; 杨雅斐; 王海岗; 陈凌; Santra Dipak K; 王瑞云^*; 乔治军

来源：山西农业科学, 2023, 51(10): 1178-1188.

• 糜黍
• SSR
• 遗传多样性
• DNA分子身份证
• 山西

应用微卫星标记对糜黍资源进行遗传多样性分析，确定其遗传背景，有利于资源的合理高效利用。以80份山西糜黍核心种质为材料，44个SSR标记为检测工具，利用软件PowerMarker 3.25和PopGen 1.32计算遗传多样性衡量参数，使用MEGA 11.0.10软件绘制聚类图，使用NTSYSpc2.11a软件进行主成分分析，应用ID Analy?sis 4.0软件构建材料的DNA分子身份证。结果表明，80份材料在44个位点共检测出130个等位变异，平均每个位点检出3个；基于UPGMA聚类分析，80份材料划归4个类群（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ），分别以晋中市、忻州市、朔州市、忻州市材料为主。主成分分析将材料划归10类（G1～G10），其中，G1均来自大同市，G2均来自朔州市，G3均来自忻州市，G4均来自太原市，G5～G10分别来自阳泉市、晋中市、吕梁市、长治市、临汾市和运城市。综合多态性信息含量（PIC）和Shannon多样性指数（I）值得出，高于平均值的SSR引物有21对（RYW3、RYW7、RYW11、RYW14、RYW18、RYW26、RYW28、RYW29、RYW30、RYW31、RYW37、RYW39、RYW40、RYW49、RYW54、RYW56、RYW61、RYW62、RYW65、RYW67和RYW82）。利用IDAnalysis4.0软件分析，发现16个SSR(RYW62、RYW67、RYW56、RYW65、RYW61、RYW40、RYW37、RYW31、RYW82、RYW29、RYW28、RYW49、RYW39、RYW54、RYW18和RYW30)组合在一起可区分全部材料。通过在线二维码生成器，对试验材料的基本信息及字符串信息进行加工处理，可得到二维码DNA分子身份证。

• 单位
  山西农业大学