血管成形术后再狭窄差异基因分析及机制探索

作者：朱虹颖; 王建波^*

来源：介入放射学杂志, 2023, 32(09): 875-880.

• 支架内再狭窄
• 经皮腔内血管成形术
• 差异表达基因
• 加权基因共表达网络分析

目的 从分子水平探索支架内再狭窄（ISR）的关键基因，以及ISR的发病机制。方法 通过基因表达综合（GEO）公共数据库获取GSE46560数据集，利用R语言的limma包分析获得ISR组与对照之间的差异表达基因（DEG），并对外周血的微阵列数据集进行加权基因相关网络分析（WGCNA），以探索ISR相关基因。为了鉴定枢纽基因，对DEG与关键模块中的交集基因进行了功能富集分析、通路分析和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络构建。通过蛋白质免疫印迹验证靶基因。结果 ISR组和对照组共鉴定出243个DEG，其中有109个上调，有134个下调。WGCNA蓝色模块包含2 934个基因，是GSE46560数据集中与ISR相关系数最高的模块。筛选DEG和WGCNA交集基因，有ITPK1、SMG9。GO富集和KEGG分析表明，基因主要富集于蛋白磷酸化、细胞周期调节和细胞增殖，以及细胞衰老和TGF-β信号通路。在Cytoscape中，获得2个枢纽基因，为MCM2、RAD52。结论 ITPK1、MCM2、RAD52可能是ISR发病机制特异性相关基因，为ISR的鉴定和治疗提供新的靶点。

• 单位
  上海海洋大学; 生命学院; 上海交通大学医学院附属第六人民医院