自噬相关基因对老年女性乳腺癌预后预测的价值

作者：孟轲; 耿一萌; 杨珍珍; 冯涵; 李冰洁; 马望^*

来源：郑州大学学报(医学版), 2022, 57(02): 181-185.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2021.03.021

• 乳腺癌
• 自噬相关基因
• 预后

目的:探索自噬相关基因(ARG)对老年女性乳腺癌预后预测的价值。方法:分别从TCGA和HADb数据库中下载得到老年女性乳腺癌504例的病例信息和ARG信息。将病例按7∶3的比例分为训练集(n=356)和验证集(n=148)。乳腺癌患者总生存期定义为从随机化开始至因任何原因死亡的时间。在训练集中，通过Cox回归分析筛选与老年女性乳腺癌患者预后相关的ARG,ARG相关风险评分=∑β_n×基因n表达水平平均值。以风险评分的中位数作为界值，将乳腺癌患者分为高风险和低风险组，比较2组预后相关ARG的表达水平，并进行GO功能富集分析和KEGG通路分析。在训练集中，以年龄、临床分期、TNM分期作为协变量，以风险评分为自变量，进行Cox回归分析，构建老年女性乳腺癌预后预测模型。在训练集和验证集中，绘制预测模型的时依ROC曲线，用于评估模型的预测能力。结果:通过Cox回归分析获得了一个包括7个ARG的风险评分，IFNG、ATG4D、ATG4A、NKX2-3、MAPK9、ATG9B、VAMP3的表达水平平均值(β)分别为0.375(-0.619)、7.667(0.137)、6.210(0.143)、0.041(3.208)、7.846(0.104)、0.590(0.192)、34.929(0.054);GO和KEGG分析结果表明，这7个ARG参与的生物学过程主要包括巨噬细胞分化、蛋白质定位至前自噬体结构、自噬等，涉及的细胞成分主要有内体膜回收，涉及的分子功能主要包括半胱氨酸肽酶活性，与自噬(动物)等通路显著相关。基于ARG相关风险评分的预测模型中，年龄、临床分期、T分期、N分期、M分期及ARG相关风险评分的HR(95%CI)分别为1.072(1.030～1.116)、1.774(0.774～3.928)、0.830(0.523～1.316)、0.502(0.137～1.839)、1.430(0.870～2.350)、1.276(1.168～1.394);该模型在验证集中对患者3、5、10 a生存概率预测的ROC曲线下面积(95%CI)分别为0.769(0.546～0.992)、0.714(0.516～0.912)、0.803(0.615～0.992)。结论:筛选出的ARG对老年女性乳腺癌预后具有一定的预测价值。

• 单位
  郑州大学第一附属医院