吉林省2012年柯萨奇病毒A组16型基因亲缘关系及氨基酸位点变异分析

作者：沈博; 魏雷雷; 王爽; 曹凤瑞; 程涛; 田鑫; 单元春; 李可维; 周剑惠; 范明

来源：中国疫苗和免疫, 2014, 20(06): 538-541.

DOI：10.19914/j.cjvi.2014.06.013

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A组16型
• VP1编码区
• 基因特征

目的了解吉林省2012年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease;HFMD)来源的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackie Virus Group A Type 16,CVA16)基因亲缘关系及氨基酸位点的变异情况。方法收集吉林省2012年73例HFMD临床标本,病毒分离后对其中22株的VP1编码区部分核苷酸进行序列测定和分析。结果 22株CVA16中,12株为B1a基因亚型,10株为B1b基因亚型,12株B1a基因亚型氨基酸同源性为95.0%97.8%,10株B1b基因亚型氨基酸同源性为94.3%97.0%;有8株在第23位氨基酸位点发生了亮氨酸(Leucine,L)→蛋氨酸(Methionine,M)的变异,其余14株在该氨基酸位点均为L。结论 CVA16为吉林省HFMD的主要病原体之一,毒株间的同源性较高,均属于B基因群,在系统进化树上分别属于两个进化分支。

• 单位
  吉林省卫生监测检验中心; 吉林省疾病预防控制中心