基于高通量测序的口腔鳞状细胞癌环状RNA-微RNA筛选及其作用的初步研究

作者：卫佳宁; 高继萍; 续国强; 王晓堂; 宋国华^*

来源：中国药物与临床, 2020, 20(14): 2321-2324.

• 口腔肿瘤
• 鳞状细胞癌
• 高通量测序
• 非编码RNA

目的探讨中国地鼠口腔鳞状细胞癌(鳞癌)全转录组测序中非编码RNA差异表达的关系。方法应用高通量测序技术和生物信息学软件分析中国地鼠口腔鳞癌相关非编码RNA数据,筛选在口腔鳞癌发生发展中差异表达的环状RNA(circRNA)和微RNA(mi RNA)。通过mi Randa靶向预测差异circRNA-miRNAmRNA之间的互作关系,Cytoscape软件建立circRNA-miRNA互作网络图,并结合实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)方法验证靶向互作关系在口腔鳞癌中的表达情况。结果从高通量测序结果中筛选了14个共表达circRNAs和75个共表达mi RNAs,成功构建了口腔鳞癌相关circRNA-miRNA网络,结合软件预测到了cgrcircMan2a1/cgrmiR-1260/Notch2和cgrcircPdcd4/cgr-miR-15b-5p/Akt3 2条通路,并在基因水平验证了通路中基因的表达关系。结论本研究为circRNA的竞争性内源机制在口腔鳞癌的发生发展中的研究提供了新的见解,为进一步研究奠定基础。

• 单位
  山西医科大学