人胃上皮细胞系GES-1在不同pH环境下的串联质谱标签定量蛋白质组学分析

作者：施韵; 何坪; 涂旭东; 张玉娟^*

来源：基因组学与应用生物学, 2022, 41(06): 1339-1349.

DOI：10.13417/j.gab.041.001339

• 酸性pH
• 碱性pH
• 串联质谱标签
• 蛋白质组测序
• 功能富集

胃是人体重要的消化器官，胃部环境pH改变可能引发多种疾病。本研究探究了不同pH环境对胃上皮细胞系GES-1蛋白质组的影响。将GES-1放置在酸性(pH 6.8)、碱性(pH 9.4)和对照(pH 7.4)培养基中，培养7 d后收集细胞沉淀，进行串联质谱标签(tandem mass tags, TMT)定量蛋白质组学测序，选择差异表达蛋白进行KEGG富集分析。结果表明，胃上皮细胞GES-1最适生长pH为7.4,在强碱环境(pH 9.4)中细胞能保持较好的状态，在弱酸环境(pH 6.8)中难以维持正常细胞形态。与对照组相比，136个蛋白在酸性(pH 6.8)样品中显著差异表达，其中96个蛋白上调，40个蛋白下调。KEGG富集结果显示，差异蛋白与胆汁分泌、丙酮酸代谢、抗原加工呈递、铁死亡等103个生物学过程相关；与对照组相比，15个蛋白在碱性(pH 9.4)样品中显著上调，1个蛋白显著下调，差异蛋白被富集到47个生物学过程，包括霍乱弧菌感染、补体与凝血级联、内质网中的蛋白质加工、蛋白质输出等。本研究揭示了GES-1细胞响应pH环境改变的蛋白质组特点，为探究因环境pH变化引发的胃部病变提供了新的思路。

• 单位
  重庆师范大学; 生命科学学院; 重庆医药高等专科学校