宏基因组测序诊断鹦鹉热衣原体肺部感染4例并文献复习

作者:陈欣; 刘霜; 赵旭; 毕颖敏; 巨默涵; 袁瑾懿*; 徐晓刚
来源:中国感染与化疗杂志, 2021, 21(06): 680-687.
DOI:10.16718/j.1009-7708.2021.06.008

摘要

目的探索宏基因组测序(mNGS)在鹦鹉热衣原体肺部感染诊断中的应用,为该病的诊断和治疗提供参考。方法采用mNGS对2019年12月—2020年12月复旦大学附属华山医院101例肺部感染患者的呼吸道标本进行测序,收集鹦鹉热衣原体阳性患者的临床资料;以"鹦鹉热"和"测序"为检索词检索知网数据库、万方数据库及维普数据库,以"psittac"和"next generation sequencing"为检索词检索PubMed数据库,检索年限不限,检索出经mNGS诊断鹦鹉热衣原体感染23例,并结合本研究检出鹦鹉热衣原体的病例进行分析。结果采用mNGS检测101例肺部感染患者的呼吸道标本,4例检出鹦鹉热衣原体序列。综合文献报道和该院4例鹦鹉热衣原体肺炎共27例,时间跨度从2019—2020年。临床表现主要为发热(100%)、咳嗽(63.0%)、咯痰(55.6%)。肺部CT主要表现为实变(13/27,48.1%)和胸腔积液(11/27,40.7%),14例(51.9%)病变仅累及单个肺叶。在诊断前6例(22.2%)治疗未覆盖非典型病原体,诊断后10例(37.0%)应用单药治疗,以多西环素或莫西沙星最为常用。鹦鹉热衣原体肺炎预后较好,26例(96.3%)患者在有效治疗后好转。结论 mNGS技术已成为临床上诊断鹦鹉热衣原体主要的检出方法之一。四环素类或氟喹诺酮类治疗该微生物所致感染可取得较好疗效。