利用SNP标记划分玉米地方种质杂种优势类群

作者:张培风; 任帅; 孙佩; 王蕊; 张瑞平; 王文洁; 马朝阳; 李合顺; ***; 周联东*
来源:中国种业, 2023, (02): 70-75.
DOI:10.19462/j.cnki.1671-895x.2023.02.042

摘要

利用1021个SNP标记对20份参照物和100份地方种质资源的基因型进行分析,结果表明,1021个SNP标记在供试材料中的平均多态性信息含量(PIC)为0.295,杂合率在0~29.3%之间,平均杂合率为2.5%;缺失率在0~19.4%之间,平均缺失率为1.7%。120份地方种质间遗传距离变化范围为0.453~0.653。根据遗传距离信息,通过NJ聚类分析,将供试的120份地方种质划分为7个杂种优势群,划群结果和系谱来源具有较好的一致性,100份河南地方种质全部聚为一类,被划分为黄源群,表明来自河南的地方种质遗传背景相同,亲缘关系较近,纯合度较高。其中遗传距离最小的2个地方种质资源是短腿玉米和黄马牙,纯合度较高,遗传关系最近,遗传距离为0.010。研究结果可作为杂优模式的选择依据。

  • 单位
    河南省新乡市农业科学院