摘要
油莎豆是一种发展潜力巨大的的特色油料作物。在全基因组范围内大量挖掘SNP和InDel位点,能为油莎豆种质资源的鉴定和利用以及优良品种的选育提供技术保障。本研究利用SLAF-seq技术对3个不同类型油莎豆品种(‘YYS1’、’YYS2’和’YYS3’)进行了酶切建库测序,经过序列过滤和聚类分析,共获得2765个高质量SLAF标签。利用GATK和SAMtools软件从这些SLAF标签中鉴定到2 352个SNP位点和1556个InDel位点;除去3个油莎豆品种间相同的杂合性位点,筛选出了1 304个多态性SNP位点和60个多态性InDel位点,并得到了PCR特异性扩增和测序验证。基于多态性位点进行3个油莎豆品种的遗传分析,发现圆粒型的’YYS1’和’YYS2’之间的亲缘关系较近,二者与长粒型’YYS3’之间的亲缘关系较远;但3个油莎豆品种整体的遗传距离较小,仅为0.20左右,具有相对较低的遗传多样性。以上结果表明,利用SLAF-seq技术开发出了大量的SNP和InDel位点,极大地丰富了油莎豆的分子标记资源,为进一步油莎豆种质资源的精准鉴定和遗传分析提供参考。
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