丙戊酸钠抗癫痫疗效相关枢纽基因鉴定

作者：杨炯; 张明华^*; 耿淼; 艾伦娜; 田磊; 范皎^*

来源：中国药理学通报, 2022, 38(09): 1408-1415.

• 癫痫
• 丙戊酸钠
• 疗效
• 加权基因共表达网络分析
• 枢纽基因
• 免疫反应

目的 采用加权基因共表达网络分析探索抗癫痫药物丙戊酸钠疗效相关的基因模块及核心枢纽基因。方法 从GEO数据库下载表达谱数据，构建基因共表达网络；采用Pearson相关性检验筛选与抗癫痫药物丙戊酸钠疗效显著相关的基因模块，根据模块内的连接性筛选枢纽基因；利用GO功能富集分析和KEGG通路分析对模块进行功能注释。结果 根据基因表达的相关性，共构建了12个基因共表达模块，其中分别选出与是否采取丙戊酸钠药物治疗表型明显相关(r=0.57,P <0.000 1)和与丙戊酸钠治疗是否有效表型显著相关(r=-0.53,P <0.000 1)的两个基因模块;发现包含S1PR5、SARM1等基因以及MAGED1、FBXO31等基因分别在两个模块中处于核心地位;通过生物注释功能发现，两个模块中的基因主要富集在免疫调控、MAPK通路等生物学过程中。结论 丙戊酸钠用药引起癫痫患者体内免疫和代谢通路变化，其疗效是否显著可能与MAGED1、FBXO31等基因功能相关。

• 单位
  中国人民解放军总医院