基于小RNA测序的甜樱桃病毒种类检测及鉴定

作者：赵志惠; 李丰; 朱天生^*; 高瑞; 孙玉刚

来源：落叶果树, 2022, 54(02): 9-13.

DOI：10.13855/j.cnki.lygs.2022.02.003

• 甜樱桃
• 病毒病
• 高通量测序

病毒病是甜樱桃的重要病害之一，利用高通量测序技术鉴定病毒病害种类，通过对2个表现“花脸”症状的甜樱桃样品YT-1和YT-2进行小RNA测序，并对获取的小RNA进行组装注释。结果表明，样品YT-1获得14 190 241条reads,鉴定到的主要病毒是樱桃小果病毒2,占小RNA的55.12%,还包括李属坏死环斑病毒、樱桃病毒病A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒、樱桃绿环斑驳病毒及啤酒花矮化类病毒；样品YT-2获得14 954 849条reads,鉴定到的主要病毒是李属坏死环斑病毒，占小RNA的59.05%,还包括樱桃病毒A、李树皮坏死茎纹孔伴随病毒及樱桃绿环斑驳病毒。

• 单位
  山东省果树研究所; 塔里木大学