模拟炎性环境下强直性脊柱炎患者MSC的基因表达

作者：李玉希; 刘婷; 谢中瑜; 李进腾; 王鹏; 沈慧勇

来源：中山大学学报(医学科学版), 2016, 37(06): 845-851.

DOI：10.13471/j.cnki.j.sun.yat-sen.univ(med.sci).2016.0116

• 强直性脊柱炎
• 间充质干细胞
• 全基因组表达谱芯片

【目的】研究炎性环境下强直性脊柱炎(AS)患者间充质干细胞(MSC)中的全基因组表达谱基因的表达情况。【方法】首先从AS患者骨髓腔中分离培养MSC并利用流式技术鉴定细胞特定表型;然后利用TNF-α(10 ng/m L)和IFN-γ(10 ng/m L)刺激模拟炎症环境;接着分别提取不同条件刺激下AS患者和正常人MSC中RNA并进行RNA质控;然后行全基因组基因芯片分析,并应用GO分析法和KEGGPathway分析法分析其中的差异表达基因和寻找相关信号通路;最后利用q RT-PCR方法验证上述基因芯片中筛选出的关键差异表达基因真实性。【结果】全基因组基因芯片分析结果显示炎性模拟环境培养下AS-MSC中差异表达基因数量明显增加,GO分析结果显示这些差异表达基因中,56.1%与生物学活动相关,28.99%与分子功能相关,14.91%与细胞构成相关。Kegg-Pathway分析结果显示这些差异表达基因主要与TLR信号通路和MAPK信号通路这两条通路密切相关,其中TLR信号通路包含8个差异表达基因,MAPK信号通路包含14个差异表达基因。q RT-PCR验证结果显示基因表达与基因芯片结果符合。【结论】炎性模拟环境下,AS-MSC中的差异表达基因数量明显增加,并且这些差异表达基因主要以TLR信号通路和MAPK信号通路为主。

• 单位
  中山大学孙逸仙纪念医院