基于数据挖掘分析SLC7家族在肺鳞状细胞癌组织中的表达及其临床价值

作者：张雅琴; 戴炜; 吴娟; 陈加弟; 曹颖平^*

来源：现代肿瘤医学, 2021, 29(23): 4129-4133.

• 肺鳞状细胞癌
• SLC7家族
• 生物信息学
• 预后

目的:探索氨基酸转运蛋白家族(SLC7)基因在肺鳞状细胞癌(lung squamous cell carcinoma, LUSC)组织中的表达及其临床价值。方法:利用GEPIA、cBioportal等生物信息学在线分析和可视化网站,分析公共数据库TCGA中的LUSC组织中SLC7家族基因表达和变异情况;通过Kaplan-Meier Plotter分析SLC7家族对LUSC的预后价值;通过STRING在线工具获得SLC7家族潜在的互作蛋白,并利用GO和KEGG对其进行功能和通路的富集分析,探索SLC7家族在LUSC中可能的调控机制。结果:SLC7A1、SLC7A5、SLC7A8和SLC7A11在LUSC组织中表达显著升高,SLC7A2、SLC7A6和SLC7A7在LUSC组织中表达降低;癌症基因组学分析显示,469例LUSC样本中SLC7基因家族总变异率为53.73%,主要以扩增为主(占32.2%)。SLC7家族的表达与预后关系分析结果显示,SLC7A2低表达和SLC7A5高表达的LUSC患者总体生存率降低,暗示SLC7A2和SLC7A5可能可以作为预后标志物。GO和KEGG分析发现SLC7家族蛋白及其潜在互作蛋白显著富集于蛋白消化吸收、癌症中心碳代谢和铁死亡相关通路。结论:SLC7A2和SLC7A5可能是LUSC潜在的预后标志物。

• 单位
  福建医科大学附属协和医院; 福建医科大学