大熊猫遗传多样性评估的微卫星分型体系优化

作者：寇洁; 李严; 王鹏; 刘红; 刘佳文; 王涓; 王也; 张亮; 沈富军^*

来源：遗传, 2022, 44(03): 253-275.

DOI：10.16288/j.yczz.21-348

• 大熊猫
• 遗传多样性
• 微卫星标记
• STR-PCR

微卫星作为重要的分子标记之一，已被证明在大熊猫种群规模评估、亲子鉴定和遗传多样性分析方面是有效的。目前微卫星标记在大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)染色体上物理定位方面的报道较少，而且缺乏微卫星基因分型系统的效能评估以及PCR扩增条件的优化。本研究基于大熊猫基因组参考序列(ASM200744v2)，分析了34个大熊猫微卫星位点的染色体定位特征并评价了位点的应用价值。通过优化34个STR-PCR反应体系和扩增程序，结合微卫星的染色体定位数据确定了Ame-μ10标记的较低应用价值以及gpz-6重新筛选引物的必要性。本研究有助于提高基因分型结果的重复性和可靠性，对促进《大熊猫种群遗传档案建立技术规程》规范化应用和制定大熊猫保护策略具有重要意义。

• 单位
  西南科技大学; 成都大熊猫繁育研究基地; 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室