一个拮抗灰葡萄孢菌的AMP核苷酶基因的生物信息学分析

作者：贾立君; 李凤霞; 马汇泉

来源：黑龙江八一农垦大学学报, 2013, (01): 32-36+49.

• 宏基因组文库
• 灰葡萄孢菌
• 拮抗基因
• 生物信息学分析 metagenomic library
• Botrytis cinerea
• antagonist gene
• Bioinformatics analysis

运用生物信息学工具和软件对一个从土壤宏基因组文库中获得的AMP核苷酶基因进行初步预测和分析,该基因的最大开放阅读框为612 bp,编码203个氨基酸,预测的蛋白质分子量为22.186 7 kDa,是一个小分子量疏水性脂溶蛋白,含有5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶磷酸化位点,3个N-豆蔻酰化位点,这些位点均与细胞内信号传导、蛋白定位以及黏附等过程有关,推测该基因可能在拮抗灰葡萄孢菌过程的信号转导和分子识别中发挥重要作用。

• 单位
  黑龙江省农业科学院佳木斯分院; 山东理工大学