艾Artemisia argyi实时荧光定量PCR内参基因筛选

作者:易小哲; 邬兰; 向丽; 王梦月; 陈士林; 师玉华; 刘霞
来源:中国中药杂志, 2022, 47(03): 659-667.
DOI:10.19540/j.cnki.cjcmm.20210919.101

摘要

艾叶是中国传统中药,在药用和灸用产品的市场需求日益增加,具有重要的药用价值和经济价值。筛选稳定可靠的qRT-PCR内参基因是开展艾的基因表达差异分析研究的必要前提。该研究从艾的转录组数据中选取Actin、18s、EF-1α、GAPDH、SAND、PAL、TUA、TUB 8个常用的内参基因作为候选基因,利用实时荧光定量技术(qRT-PCR)检测各个候选基因在艾的不同组织(根、茎、叶)中和茉莉酸甲酯(MeJA)处理后不同时间点(0、4、8、12 h)的表达水平,然后应用geNorm、NormFinder、BestKeeper、ΔCT和RefFinder综合分析候选内参基因表达的稳定性,结果表明在艾的不同组织中和MeJA处理后表达最稳定的内参基因均是Actin,SAND次之。进一步检测萜类合成酶途径DXS和MCT基因在艾的不同组织中和MeJA处理后的表达水平,结果表明以Actin和SAND作为内参基因计算出的DXS、MCT的表达趋势一致,验证了筛选结果的可靠性。综上,该研究发现Actin是最适合艾的不同组织和MeJA处理后基因表达研究的内参基因,将为艾叶的基因表达分析提供科学参考,同时为艾叶品质形成的分子机制研究奠定基础。

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