ABCA1基因编码区稀有变异与原发性开角型青光眼关联分析

作者：徐玉霞; 黄璐琳; 龚波; 陈宇虹; 孙兴怀; 杨正林

来源：中华实验眼科杂志, 2019, 37(06): 439-445.

DOI：10.3760/cma.j.issn.2095-0160.2019.06.007

• 开角型青光眼/基因
• 基因变异
• DNA序列分析/方法
• 非同义变异
• 全外显子测序
• ABCA1基因

目的对原发性开角型青光眼(POAG)患者ABCA1基因编码区变异进行分析,探讨ABCA1基因稀有非同义变异在POAG患者中的分布情况。方法采用前瞻性队列研究方法,自2017年3月至2018年3月共招募复旦大学附属眼耳鼻喉科医院就诊的POAG患者398例,并招募同期就诊的年龄和性别匹配的健康对照者198人。采集受检者外周静脉血2～5 ml,提取基因组DNA,利用全外显子测序(WES)技术对受检者ABCA1基因50个外显子区的稀有非同义变异进行测序和分析。结果 POAG患者ABCA1基因稀有非同义变异检出率为6.8%(27/398),发现21个稀有非同义变异位点,其中有4个新变异,包括c.4310C>A(p.Thr1437Asn)、c.3772G>T(p.Asp1258Tyr)、c.775A>G (p.Lys259Glu)和c.15071508insGAGGT(p.Glu503GlyfsX7)。健康对照者ABCA1稀有变异检出率为2.5%(5/198),PGAG患者ABCA1稀有变异检出率明显高于健康对照者,差异有统计学意义(χ2=4.72,P=0.03,OR=2.81)。结论 ABCA1的稀有非同义变异与POAG发病有一定关联,丰富了ABCA1基因的稀有变异谱。

• 单位
  成都中医药大学; 四川省人民医院; 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院