本发明公开了一种基于杜氏盐藻代谢途径和雨生红球藻BKT的产虾青素工程菌及其构建方法与应用。该工程菌以杜氏盐藻为材料,通过插入雨生红球藻β-胡萝卜素酮化酶(BKT),使BKT在该重组藻细胞内稳定表达,可实现杜氏盐藻由β-胡萝卜素到虾青素的转化,进一步实现虾青素在杜氏盐藻中的积累,为天然虾青素的生产开辟了一条新的途径。