陕西榆林地区鸡蛔虫的单倍型多态性、遗传分化及种系发育关系分析

作者：崔巍山; 李中波^*

来源：中国家禽, 2023, 45(12): 101-107.

DOI：10.16372/j.issn.1004-6364.2023.12.016

• 鸡蛔虫
• cox1
• nad4
• 基因变异
• 单倍型多态性
• 遗传分化
• 种系发育关系

为探究陕西榆林地区鸡蛔虫单倍型多态性及遗传分化情况，并阐明其种系发育关系，试验以分离于榆林不同地区的30条鸡蛔虫为样品，采用PCR扩增其线粒体cox1与nad4基因，进行单倍型多态性、遗传分化与种系发育关系分析。结果显示：在所有的cox1基因（953 bp）序列中，共含30个变异位点（4个转换、26个颠换），17个单倍型（h=17,Hd=0.936），其基因分化系数（Gst）为-0.012 85，遗传分化系数（Fst）为-0.029 95，基因流（Nm）为11.53；在所有的nad4基因（876 bp）序列中，共含29个变异位点（2个转换、27个颠换），16个单倍型（h=16,Hd=0.935 6），其Gst为-0.012 38,Fst为-0.040 9,Nm为17.05；在所有的cox1+nad4基因（1 829 bp）序列中，共含59个变异位点（6个转换、53个颠换），24个单倍型（h=24,Hd=0.977），其Gst为-0.003 9,Fst为-0.036 5,Nm为14.77；在所有cox1、nad4及cox1+nad4基因的Network图中，均未发现有单倍型聚集成簇的现象，构建的种系发育树中30条鸡蛔虫均聚集于一起，共同形成种系发育树的一个分支。研究表明，分离于陕西榆林地区的30条鸡蛔虫之间虽存在一定程度的基因变异，但其个体及单倍型之间具有较近的亲缘关系，尚未出现遗传分化。

• 单位
  怀化职业技术学院; 榆林职业技术学院