武汉市HIV-1相关基因序列分析及亚型分布

作者：唐力; 邢辉; 彭劲松; 刘胜牙; 王夏; 周旺; 郑华英; 刘满清; 鄢慧民

来源：中国人兽共患病学报, 2007, 23(11): 1071-1074+1078.

DOI：10.3969/j.issn.1002-2694.2007.11.002

• 艾滋病病毒
• 基因亚型
• 套式聚合酶链反应
• 分子流行病学

目的研究武汉市HIV感染人群中的HIV毒株的亚型分布特点和流行规律。方法采集武汉市60名已被确认为HIV-1感染者的抗凝全血样品,提取前病毒DNA,用巢式聚合酶链反应方法(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V5区及gag基因的部分区段,对PCR纯化产物直接测序,并应用GCG软件对序列进行分析。结果通过PCR扩增得到60份样品的结果,其中env基因序列45份、gag基因序列52份。依据env和gag区基因序列,与HIV-1各个亚型国际参考株比较,通过系统进化分析,最后确定武汉市样品分属5个亚型,分别为HIV-1B亚型中的泰国B(B’)亚型32份,流行重组型CRF07-BC12份,流行重组型CRF01-AE9份,A亚型1份和C亚型6份。结论武汉市存在多种HIV-1亚型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。

• 单位
  中国疾病预防控制中心; 病毒学国家重点实验室; 武汉市疾病预防控制中心