大鳍鳠GHR基因CDS区克隆及生物信息学分析

作者：葛玲瑞; 刘科均; 张建国^*

来源：湖南农业科学, 2022, (05): 7-17.

DOI：10.16498/j.cnki.hnnykx.2022.005.002

• 大鳍鳠
• GHR基因
• 克隆
• 生物信息学分析

该研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术成功克隆到大鳍鳠的GHR基因，获得了其完整的CDS区序列；通过同源序列比对构建了大鳍鳠的系统进化树，并采用生物信息学的方法分析了大鳍鳠GHR蛋白的特性。结果表明：大鳍鳠GHR基因CDS区长度为1 731 bp，编码576个氨基酸；大鳍鳠与黄颡鱼、斑点叉尾鮰的亲缘关系较近，它们之间GHR基因的同源性分别为90.3%、88.7%，但是与哺乳动物的亲缘关系较远；大鳍鳠GHR蛋白分子式为C2900H4483N765O888S28，属于跨膜蛋白，其二级结构由α-螺旋(20.66%)、延伸链(24.13%)和无规则卷曲(55.21%)组成，三级结构预测结果与二级结构一致；该蛋白能与GH1、GH2、CISH、JAK2和STAT5A等分子形成互作网络。

• 单位
  湖南生物机电职业技术学院