胰腺癌中关键RNA结合蛋白的功能及预后评估价值

作者：陈钦钦; 杨凌志; 彭心宇^*

来源：中国现代医药杂志, 2021, 23(01): 5-11.

• 胰腺癌
• RNA结合蛋白
• 生物信息学
• 生存分析
• 预后模型

目的探讨胰腺癌中差异表达RNA结合蛋白(RBPs)的功能及其相关信号通路,构建预后模型评估胰腺癌患者的预后,为胰腺癌的诊断、治疗和预后评估提供新思路。方法利用TCGA数据库中胰腺癌患者的RNA-Seq数据,运用limma包进行差异分析,将得到的差异表达RBPs进行GO富集分析和KEGG信号通路分析并绘制PPI网络及其子网络。通过survival包筛选预后相关RBPs构建预后模型,并通过生存分析、ROC曲线绘制、风险函数评估、独立预后分析进行验证,绘制列线图有效评估预后。结果筛选出6个上调RBPs和9个下调RBPs,构建了由ESRP1、TDRD6、RBM6、DARS2组成的预后模型并进行验证。结论筛选差异表达的RBPs并构建预后模型,可为探讨胰腺癌的发病、诊断和药物治疗靶点提供方向。

• 单位
  石河子大学; 石河子大学医学院第一附属医院